1. Podle tloušťky kolony ji lze rozdělit na dva typy: obecná plněná kolona a kapilární kolona.
Náplňová chromatografická kolona: K vytvoření spirálových kolon se obvykle používají trubky z nerezové oceli s vnitřním průměrem 4-6 mm s běžně používanou délkou kolony 2-4 metrů. Naplňte kapalnou stacionární fázi (plynová kapalinová chromatografie) nebo pevnou stacionární fázi (plynová pevná chromatografie).
Kapilární chromatografická kolona: Kolona je kapilární trubice, běžně používaná jako skleněná nebo elastická křemenná kapilára s vnitřním průměrem 0.1-0,5 mm a délka kolony se pohybuje od desítek metrů na stovky metrů.
Kapilární chromatografické kolony lze podle způsobu jejich plnění rozdělit na otevřené kapilární kolony a plněné kapilární kolony.
2. Podle separačního mechanismu ji lze rozdělit na kolony distribuční a kolony adsorpční, přičemž hlavní rozdíl je ve fixní fázi.
Distribuční kolona: obecně je stacionární kapalina (kapalina s vysokým bodem varu) nanesena na nosič za vzniku kapalné stacionární fáze a separace je realizována rozdílem rozdělovacího koeficientu složek. Funkční skupiny stacionárního roztoku jsou spojeny na povrchu nosiče prostřednictvím chemické vazby, která se nazývá fáze chemické vazby. Má výhodu beze ztrát.
Adsorpční kolona: Skládá se nanesením adsorbentu do chromatografické kolony, separace je dosaženo využitím rozdílů v adsorpčních koeficientech složek. Kromě adsorbentů zahrnují pevné stacionární fáze také molekulová síta a polymerní porézní mikrokuličky.